Кафедра органической химии обеспечивает общую фундаментальную подготовку по органической химии студентов специальностей "химия", "биология" (ФЕН), студентов Медицинского факультета и студентов специальности "геология и геохимия горючих ископаемых" (ГГФ). Кафедра также осуществляет углубленную подготовку студентов 4-5 курсов ФЕН по специализации "органическая химия" (9 спецкурсов, включая спецпрактикум) и обучение, как в магистратуре, так и аспирантуре НГУ по этой специальности.

Кафедру в 1961 году организовал ее первый заведующий - академик Николай Николаевич Ворожцов (мл). Первым лектором по курсу органической химии был чл.-корр. АН СССР Владимир Петрович Мамаев.

С 1966 по 1993 годы кафедру возглавлял один из крупнейших химиков, вице-президент Академии наук, член многих зарубежных академий, вице-президент, а затем и президент IUPAC, академик Валентин Афанасьевич Коптюг.

В 1993-2003 годы кафедрой заведовал доктор химических наук, профессор Виталий Давидович Штейнгарц, долгие годы работавший вместе с В. А. Коптюгом в стенах кафедры и в Новосибирском институте органической химии СО РАН.

В 2003-2008 годы кафедра работала под руководством директора Института органической химии СО РАН, доктора химических наук, профессора Игоря Алексеевича Григорьева.

Преподавательскую работу на кафедре ведут высококвалифицированные специалисты, в том числе 7 докторов и 12 кандидатов химических наук. Среди сотрудников кафедры - как штатных, так и совместителей - подавляющее большинство составляют выпускники НГУ.