Электронный архив НГУ

Методы обнаружения логических закономерностей в структуре геномов

Показать сокращенную информацию

dc.contributor.author Виктор Александрович Гусев ru_RU
dc.contributor.author Геннадий Сергеевич Лбов ru_RU
dc.contributor.author Галина Леонидовна Полякова ru_RU
dc.contributor.author Вера Сергеевна Алтынцева ru_RU
dc.contributor.author Виктор Александрович Габриэль ru_RU
dc.creator Институт математики СО РАН ru_RU
dc.creator Institute of Mathematics SB RAS en_EN
dc.creator Новосибирский государственный университет ru_RU
dc.creator Novosibirsk State University en_EN
dc.date.accessioned 2013-02-27T15:52:32Z
dc.date.available 2013-02-27T15:52:32Z
dc.date.issued 2013-02-27
dc.identifier.issn 1818-7900
dc.identifier.uri http://www.nsu.ru/xmlui/handle/nsu/261
dc.description.abstract Подтверждена гипотеза о наличии логических закономерностей в структуре геномов как микроорганизмов на примере E. coli, так и высших форм на примере X и Y хромосом человека. Для анализа рассматриваемых геномов был использован алгоритм полного перебора конъюнкций (L-грамм) с целью выявления логических закономерностей, обладающих высокой относительной частотой их встречаемости в бинарной последовательности. Приведено описание логико-вероятностных моделей для бинарных последовательностей и алгоритма обнаружения логических закономерностей в бинарной последовательности. ru_RU
dc.description.abstract The hypothesis of the presence of logical regularities in the structure of the genomes of organisms as in the example E.coli, and the higher forms by the example of X and Y chromosomes of Homo sapiens. For the analysis of these genomes has been used exhaustive search algorithm conjunctions (L-gram) for the discovery of logical regularities, which have high relative frequency of their occurrence in a binary sequence. An algorithm for the discovery of logical regularities in a binary sequence is proposed. The examples of the obtained logical-and-probabilistic models are given. en_EN
dc.language.iso ru ru_RU
dc.publisher Новосибирский государственный университет ru_RU
dc.subject логико-вероятностная модель ru_RU
dc.subject бинарная последовательность ru_RU
dc.subject структура генома ru_RU
dc.subject structure of the genome en_EN
dc.subject binary sequence en_EN
dc.subject logical-and-probabilistic model en_EN
dc.title Методы обнаружения логических закономерностей в структуре геномов ru_RU
dc.title.alternative Methods for the discovery of logical regularities in the structure of the genomes en
dc.type Article ru_RU
dc.description.reference 1. Орлов Ю. Л. Анализ регуляторных геномных последовательностей с помощью компьютерных методов оценок сложности генетических текстов: Автореф. дис. … канд. биол. наук. Новосибирск, 2004. 35 с. 2. Abnizova I., Schilstra M., te Boekhorst R., Nehaniv C. L. A Statistical Approach to Distinguish between Different DNA Functional Parts // WSEAS Transactions on Computational Methods. 2003. Vol. 2. Is. 4. P. 1188–1196. 3. Abe T., Kanaya S., Kinouchi M, Ichiba Y., Kozuki T., Ikemura T. Informatics for Unveiling Hidden Genome Signatures // Genome Res. 2003. Vol. 13 (4). P. 693–702. 4. Duplij D., Duplij S. Determinative degree and nucleotide content of DNA strands // Biophys. Bull. 2000. Vol. 497. P. 1–7. 5. Jimenez-Montano M. A., de la Mora-Basanez C. R., Poschel T. The Hypercube Structure of the Genetic Code Explains Conservative and Non-Conservative Aminoacid Substitutions in vivo and in vitro // BioSystems. 1996. Vol. 39. P. 117–125. 6. Jimenez-Montano M. A. Protein Evolution Drives the Evolution of the Genetic Code and Vice Versa // BioSystems. 1999. Vol. 54. P. 47–64. 7. Negadi T. Rumer’s Transformation in Biology as the Negation in Classic Logic // Int. Journ. of Quant. Chem. 2003. Vol. 94. P. 65–82. 8. Shcherbak V. I. Arithmetic inside the universal genetic code // BioSystems 2003. Vol. 70. P. 187–209. 9. Карасев В. А. Генетический код: новые горизонты. СПб.: ТЕССА, 2003. 116 с. 10. Гусев В. А. Арифметика и алгебра в структуре генетического кода, логика в структуре генома и биохимическом цикле самовоспроизводства живых систем // Информационный вестник ВОГиС. 2005. Т. 9, № 2. С. 153–161. 11. Лбов Г. С. Методы обработки разнотипных экспериментальных данных. Новосибирск: Изд-во Наука, 1981. 160 с. 12. Лбов Г. С., Старцева Н. Г. Логические решающие функции и вопросы статистической устойчивости решений. Новосибирск: Изд-во Ин-та математики, 1999. 212 с. 13. Лбов Г. С., Бериков В. Б. Устойчивость решающих функций в задачах распознавания образов и анализа разнотипной информации. Новосибирск: Изд-во Ин-та математики, 2005. 218 с. 14. Лбов Г. С., Полякова Г. Л. Метод прогнозирования в классе логических решающих функций // Вестн. Сибирского государственного аэрокосмического университета имени академика М. Ф. Решетнева. 2010. Вып. 5 (31). С. 42–45. ru_RU
dc.subject.udc 519.6+576.895.42+519.2
dc.relation.ispartofvolume 10
dc.relation.ispartofnumber 4
dc.relation.ispartofpages 112-120


Файлы в этом документе

Данный элемент включен в следующие коллекции

Показать сокращенную информацию