Уже 10 лет мы анализируем большие массивы биологических данных — «омик» (протеомика, геномика, метаболомика, метагеномика, траскриптомика). При этом объем анализируемых данных и получаемой информации непрерывно увеличивается.
Использование принципов объектно-ориентированного программирования при анализе таких данных позволит решить сразу несколько актуальных в биоинформатике проблем. Будет существенно повышена интерпретируемость программного кода, упрощена работа с данными, а также унифицирован формат самих данных, что даст возможность без труда оперировать данными исследований в различных проектах.
В лекции будут приведены примеры работ лаборатории за последние 10 лет, посвященных изучению метагенома, транскриптома и генома человека.
Лекция привлечет студентов ФЕН, ФИТ, ММФ, ФФ, МедФ, интересующихся биологией и программированием.
Алексеев Дмитрий Глебович к.б.н., выпускник МФТИ 2007 г. С 2005 года занимается биоинорматикой в области анализа омикс данных: протеомика, геномика, транскриптомика, метаболомика. Руководил группой и лабораторией биоинформатики в НИИ ФХМ, автор программы "Введение в биоинформатику" в МФТИ. С 2016 года участвует в работе лаборатории теоретической и прикладной функциональной геномики, ФЕН. Автор более 40 научных публикаций. Основные научные интересы — сложные системы, системная биология и микробиота кишечника.
Лекция состоится по адресу: НГУ, ул. Пирогова 2, ауд. 120а (переход лабораторного корпуса), 12 мая в 16:20.
Организатор лекции: Лаборатория теоретической и прикладной функциональной геномики (ТОП-100), кафедра цитологии и генетики, ФЕН, НГУ.
.jpg "Ученый НГУ наблюдал полное солнечное затмение в штате Индиана")