Лаборатория структурной биоинформатики и молекулярного моделирования создана в 2015 году как одна из «зеркальных» лабораторий НГУ. "Зеркальные" лаборатории были образованы в партнерстве с существующими лабораториями или научными группами – подразделениями зарубежных научных и научно-образовательных учреждений. Руководят такими лабораториями приглашенные ученые, возглавляющие лаборатории-партнеры.
Руководитель - Андрей Каява, глава группы «Structural Bioinformatics and Molecular Modelling» во Франции, Монпелье.
Основные направления работы лаборатории:
Моделирование работы ферментов репарации на молекулярном уровне. Ферменты репарации устраняют повреждения в ДНК клетки, и изучение их работы имеет как фундаментальное значение, так и прикладное: блокировка работы некоторых ферментов помогает убивать клетки раковых опухолей.
Проектирование белковых конструкций для вызова иммунного ответа против ВИЧ. Несмотря на многолетние усилия множества ученых, эффективной вакцины против ВИЧ до сих пор не было создано. В то же время у некоторых ВИЧ инфицированных встречаются антитела, очень эффективно нейтрализующие вирус. Изучение механизма образования таких антител представляет и фундаментальный, и практический интерес.
Моделирование процесса образования амилоидных фибрилл при различных условиях. Болезнь Альцгеймера – серьезная проблема здравоохранения, для нее до сих пор не существует эффективного лечения. Она сопровождается образованием специфических агрегатов белков – амилоидных фибрилл. Борьба с их формированием может быть одним из перспективных направлений терапии, и для этого необходимо изучать их структурные и динамические свойства, в том числе методами молекулярного моделирования.
Международный партнер лаборатории – Национальный центр научных исследований Франции.
