Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики

# зеркальные # междисциплинарные # коллаборации

Лаборатория компьютерной транскриптомики и эволюционной биоинформатики ФЕН НГУ была создана в июне 2015 года, в рамках проекта 5-100, в партнерстве с лабораторией Иво Гроссе находящейся в университете Мартина-Лютера (Германия).

Научный руководитель лаборатории — профессор Иво Гроссе

Заведующая лабораторией - кандидат биологических наук Елена Землянская mailto: lcteb.nsu@gmail.com

Поле деятельности лаборатории- компьютерный анализ данных полногеномного секвенирования, полученных в самой лаборатории, ее партнерами, а также представленными в открытом доступе. Полногеномное секвенирование — это чтение, расшифровка последовательностей ДНК или РНК из любых биологических образцов. Анализ этих данных позволяет выявить генетические программы, заложенные в ДНК организмов, а также их отклонения при патологиях и изменениях окружающей среды. Направлениями деятельности лаборатории являются:

  1. Исследование генетики развития растений.
  2. Разработка «умных» компьютерных методов и программ для анализа Big Data в биологии.
  3. Воспитание специалистов в области компьютерной транскриптомики и биоинформатики.

Зеркальная лаборатория создана в партнерстве с кафедрой биоинформатики Университета МартинаЛютера (Германия). Научный руководитель лаборатории профессор Иво Гроссе – специалист в области биоинформатики, руководитель кафедры биоинформатики Университета Мартина-Лютера.

СМИ о нас:

  • https://www.nkj.ru/archive/articles/28102/ - Как гормон роста помог растения колонизировать сушу, "Наука и Жизнь", февраль 2016 г.
  • http://biomolecula.ru/content/1791 - "Не будь водорослью! Синтезируй ауксин эффективно!", интервью, опубликованое в конкурсе научно-популярных материалов
  • http://nsu.ru/9a3a7010060ce0204e86102dc13acce4 - Загадки эволюции растений. Интервью с ведущим научным сотрудником лаборатории к.б.н. Дмитрием Афонниковым
  • http://nsu.ru/86704303c3c6cb06554ce3e5245f9cb1  -заметка о Седьмой Международной школе молодых ученых по системной биологии и биоинформатике (SBB-2015)
  • http://nsu.ru/204f0d44ff89be9894fb7b7bb64a9755, "Об эффекте песочных часов в экспрессии генов у животных и растений",  о публичной лекции Иво Гроссе
  • http://nsu.ru/90ea6ae40c0c5947946cef58c67780c4 -"Поиск сокровища без карты", о публичной лекции Иво Гроссе

Международные партнеры лаборатории:

  1. Университет Мартина Лютера,
  2. Институт Информатики (Халле, Германия),
  3. Университет Фрайбурга (Германия),
  4. Национальный центр биотехнологический информации (США)
  5. Кафедра информационной биологии ФЕН НГУ
  6. Институт цитологии и генетики СО РАН

Переход на Сайт лаборатории

Последняя редакция: 28.09.2017 13:01