В состав Института включены
16 кафедр:
- Кафедра анестезиологии и реаниматологии профессора Зельмана В.Л. ИММТ (КафАРИММТ)
- Кафедра акушерства и гинекологии ИММТ (КафАГИММТ)
- Кафедра внутренних болезней ИММТ (КафВБИММТ)
- Кафедра клинической биохимии ИММТ (КафКБХИММТ)
- Кафедра клинической психологии ИММТ (КафКПИММТ)
- Кафедра нейронаук ИММТ (КафННИММТ)
- Кафедра психологии личности ИММТ (КафПЛИММТ)
- Кафедра сравнительной психологии ИММТ (КафСПИММТ)
- Кафедра фундаментальной медицины ИММТ (КафФМИММТ)
- Кафедра хирургических болезней ИММТ (КафХБИММТ)
- Кафедра иммунологии ИММТ (КафИИММТ)
- Кафедра клинического моделирования здоровья и персонализированной медицины ИММТ (КафКМЗПМИММТ)
- Кафедра медицинской кибернетики ИММТ (КафМКИММТ)
- Кафедра медицинской физики и бинарных технологий ИММТ (КафМФБТИММТ)
- Кафедра медицинской химии ИММТ (КафМХИММТ)
- Кафедра фармации ИММТ (КафФИММТ)