Следующий интернет-семинар
«Актуальные проблемы прикладной математики» пройдёт
9 апреля в 17:00 по новосибирскому времени (13:00 по московскому времени).
Руководители семинара: академик РАН И. А. Тайманов, член-корреспондент РАН С. И. Кабанихин, член-корреспондент РАН А. Е. Миронов, доктор физико-математических наук М. А. Шишленин.
Секретарь семинара: Н. М. Прохошин (
n.prokhoshin@g.nsu.ru)
На семинаре со своим докладом
«Создание компьютерной системы моделирования и визуализации многоклеточного организма C. elegans как актуальная междисциплинарная проблема на стыке нейробиологии, биофизики и информационных технологий» выступят
А. Ю. Пальянов,
Н. В. Пальянова,
С. С. Хайрулин (Институт систем информатики имени А. П. Ершова СО РАН, Институт молекулярной биологии и биофизики — структурное подразделение ФИЦ ФТМ).
Проблема создания сложной многоуровневой компьютерной модели живого организма, включающей его нервную систему, рассматривается как новое перспективное направление на стыке нейробиологии, биофизики, кибернетики и компьютерного моделирования. Наиболее вероятным претендентом на роль первого «виртуального организма» считается детально изученное беспозвоночное, нематода C. elegans, нервная система которой представлена всего 302 нейронами. Задача создания виртуального организма именно на его основе представляется необходимым шагом на пути к более сложным нервным системам. В докладе рассматриваются вопросы, связанные с трехмерным компьютерным моделированием биомеханики движения C. elegans в различных средах, а также с моделированием активности его нервной, сенсорной и мышечной систем. Представлены полученные нами результаты как в области разработки специализированного программного обеспечения для осуществления симуляции тела виртуального организма (снабженного мышечной системой и способного регистрировать механосенсорные сигналы) и его движения в трехмерной среде с действующими физическими законами, так и в области моделирования нейронной активности с учетом электрофизиологических особенностей C. elegans. В симуляторе поддерживаются расчеты динамики несжимаемой жидкости, эластичных объектов, мышечных волокон и водонепроницаемых пленок, на основе которых конструируется как сам организм, так и его окружение. Для повышения производительности используются параллельные вычисления на GPU с использованием OpenCL. Начиная с 2011 г. работа в рамках данного направления исследований ведётся в сотрудничестве с некоммерческим международным проектом OpenWorm (www.openworm.org), целью которого является биологически достоверное моделирование систем C. elegans и создание на его основе первого в мире виртуального организма.
Для участия в семинаре необходимо подключиться 9 апреля после 16:45 по новосибирскому времени (12:45 по московскому времени) к конференции Zoom по ссылке
https://zoom.us/j/89776462466 или по идентификатору конференции 897 7646 2466.
Обратите, пожалуйста, внимание на следующие правила проведения интернет семинара:
- Для предотвращения появления спам-ботов будет повышена безопасность и включен зал ожидания, поэтому желательно входить под своим именем и фамилией
- На время доклада просьба отключить микрофон
- Для удобства докладчика рекомендуется размещать вопросы заранее в чате
