Подпроект «3D-геномика индивидуальных клеток» — Новосибирский государственный университет

Изучение геномных механизмов, функционирующих в индивидуальных клетках, до недавнего времени оставалось за гранью инструментальных возможностей методов.
В рамках подпроекта разрабатывается набор технологий для комплексного анализа эпигенетического статуса индивидуальных клеток животных.

Одним из направлений развития подпроекта является создание новых систем для детекции различных геномных мутаций, в том числе в единичных клетках или небольших клеточных агрегатах, полученных из биопсийного материала. Разработка технологий геномной диагностики может быть использована для замещения зарубежных тест-систем для детекции соматических и генеративных мутаций, вызванных, в том числе, радиационным облучением.

В рамках подпроекта планируется разработать методы анализа профиля метилирования и трехмерной укладки ДНК в индивидуальных клетках и апробировать эти методы для исследования эпигенетического статуса хроматина в ооцитах и ранних эмбрионах животных.


fishman.png

Фишман Вениамин Семенович

Руководитель подпроекта к.б.н., в.н.с. НОЦ «Институт генетических технологий» НГУ, в.н.с. Института цитологии и генетики СО РАН


Результаты

В рамках подпроекта «3D-геномика индивидуальных клеток» в 2021/2022 году в НОЦИГТ НГУ были разработаны и апробированы новые высокочувствительные методы анализа укладки генома и профиля метилирования ДНК. Создан центр компетенций в области 3D-геномики, позволяющий инициировать и реализовывать проекты мирового уровня в области генетики и генетических технологий»
otchet_1.jpg