«Транскриптомика отдельных клеток» — Новосибирский государственный университет

Подпроект направлен на развитие методов изучения транскриптомных профилей на уровне отдельных клеток, в частности, на разработку и стандартизацию методов анализа и интерпретации транскриптомных данных.

Исследования транскриптомов на уровне отдельных клеток и развитие программных инструментов для анализа соответствующих данных критически важно, в том числе для прецизионной, высокоразрешающей оценки воздействия различного рода физических факторов (в том числе излучений) на функционирование тканей человека, животных и растений.

В результате реализации подпроекта:
  • будут настроены стандартизованные программные конвейеры для анализа данных секвенирования транскриптомов отдельных клеток (оформлены соответствующие протоколы); 
  • разработаны новые методы анализа и интерпретации транскриптомных данных.



zemlyanskaja.png

Землянская Елена Васильевна

Руководитель подпроекта, к.б.н., в.н.с. НОЦ «Институт генетических технологий» НГУ, с.н.с. Института цитологии и генетики СО РАН


Результаты

В рамках подпроекта «Транскриптомика отдельных клеток» в 2021/2022 году в НОЦИГТ НГУ был настроен стандартный конвейер программ для анализа данных секвенирования РНК отдельных клеток, а также разработан компьютерный метод, облегчающий аннотацию клеточных типов по данным секвенирования РНК отдельных клеток.
Frame 8 (1).png