Землянская Елена Васильевна
Руководитель подпроекта, к.б.н., в.н.с. НОЦ «Институт генетических технологий» НГУ, с.н.с. Института цитологии и генетики СО РАН
Подпроект направлен на развитие
методов изучения транскриптомных профилей на уровне отдельных клеток, в частности, на разработку и стандартизацию методов анализа и интерпретации транскриптомных данных.
Исследования транскриптомов на уровне отдельных клеток и развитие программных инструментов для анализа соответствующих данных критически важно, в том числе для прецизионной, высокоразрешающей оценки воздействия различного рода физических факторов (в том числе излучений) на функционирование тканей человека, животных и растений.
В результате реализации подпроекта:
- будут настроены стандартизованные программные конвейеры для анализа данных секвенирования транскриптомов отдельных клеток (оформлены соответствующие протоколы);
- разработаны новые методы анализа и интерпретации транскриптомных данных.
Результаты
В 2023 году разработан протокол интегрированного анализа данных секвенирования транскриптомов и районов открытого хроматина с целью реконструкции регуляторных механизмов экспрессии генов.
В рамках подпроекта «Транскриптомика отдельных клеток»
в 2021/2022 году в НОЦИГТ НГУ был настроен стандартный конвейер программ для анализа данных секвенирования РНК отдельных клеток, а также разработан компьютерный метод, облегчающий аннотацию клеточных типов по данным секвенирования РНК отдельных клеток.
.png "Frame 8 (1).png")
